Los soplos son causados por flujos de sangre turbulentos a través del corazón y los vasos. Para entender esto, hay que aprender la anatomía y fisiología normal del organismo. Te lo explico de forma fácil y simple a continuación:

Un ciclo cardíaco es el resultado de la sístole (contracción) y la diástole (relajación) del corazón. Durante la sístole la sangre ubicada en el ventrículo izquierdo (left ventricle en el esquema) se envía a través de la aorta hacia los tejidos, así estos pueden utilizar el oxígeno y nutrientes necesarios para su correcto funcionamiento. Una vez se ha conseguido la perfusión de los tejidos la sangre es recolectada y devuelta a través de la vena cava (superior e inferior en humanos porqué somos bípedos, craneal y caudal en pequeños animales) hacia el atrio derecho (right atrium en el esquema). Del atrio derecho pasa al ventrículo derecho a través de la válvula atrioventricular derecha (válvula tricúspide) y del ventrículo derecho se envía a través de las arterias pulmonares (izquierda y derecha) a los pulmones, donde se oxigena la sangre. Una vez oxigenada la sangre en los pulmones vuelve al corazón a través de las venas pulmonares llegando al atrio izquierdo. Se cierra el ciclo cuando llega al ventrículo izquierdo a través de la válvula atrioventricular izquierda (válvula mitral), donde la sangre estará lista para el siguiente ciclo cardíaco.
Todo este viaje de la sangre por el cuerpo sucede en personas y animales de una forma muy parecida. Para que sea más fácil de entender, un cardiólogo veterinario especialista europeo formula la analogía de la montaña rusa Dragon Khan, del parque de atracciones Port Aventura. El ciclo cardíaco empieza con una subida lenta por el cremallera (se llena el ventrículo izquierdo) y de repente una rápida bajada (sale la sangre por la aorta a alta presión hacia los tejidos), sucede un viaje frenético a través de los loops de la atracción (se utiliza la sangre en todos los mecanismos necesarios para hacer funcionar el organismo) y rápidamente se vuelve a empezar el ciclo.

Una vez sabemos cómo viaja la sangre por el corazón y el cuerpo, como si fuera una montaña rusa, se comprende mejor la aparición de un soplo.
La turbulencia puede estar causada por la alteración del flujo sanguíneo debido a un agujero que no debería haber (como por ejemplo un defecto del septo ventricular o auricular), un estrechamiento del paso de la sangre a través de una válvula (por ejemplo estenosis aórtica o pulmonar), una regurgitación en la que la sangre retrocede debido al incorrecto cierre de una válvula (por ejemplo insuficiencia mitral o tricúspide), una conexión anormal entre grandes vasos (en el conducto arterioso persistente existe un fallo en el cierre de este conducto en el momento del nacimiento), o puede ser debida a alteraciones en la viscosidad de la sangre o a cambios en el diámetro de vasos sanguíneos.